В конце XVII века, вместе с уменьшением риска нападения пиратов и после изгнания турок (в 1684 году), жители начинают возвращаться на побережье, и постепенно строится новое поселение, название которого - Башка Вода – впервые упоминается в 1688-м году. Первое общественное сооружение в городке – церквушка Св. Лаврентия, построенная в 1750 году в стиле позднего барокко на фундаментах более раннего античного сооружения. Кроме растениеводства местное население все больше начинает ориентироваться на море и заниматься рыбной ловлей и мореплаванием. Первая школа открывается в 1845 году, а 1889 году - построена церковь Св. Николая в ново-романском стиле, в 1900 году - открыто почтовое отделение.
Вместе со строительством в 1912 году пирса Башка Вода становится важным региональным портом, через который развивается интенсивная торговля между островами и Загорьем.