Koncom XVII. storočia, keď pominulo nebezpečenstvo pirátov a po vyhnaní Turkov (1684) sa obyvateľstvo vracia na pobrežie a pomaly buduje nové osídlenie, ktorého názov, Baška Voda, sa prvýkrát spomína v roku 1688. Prvou verejnou stavbou je neskorobarokový kostol sv. Lovru, ktorý bol postavený v r. 1750 na základoch antickej stavby. Okrem poľnohospodárstva sa obyvateľstvo obracia k moru a zaoberá sa rybolovom a námorníctvom. Prvá škola sa otvára v r. 1845, kostol sv. Nikolu (Mikuláša) sa stavia v neoromantickom slohu v r. 1889 a v r. 1900 sa otvára aj pošta.
Výstavbou prístavu v r. 1912 sa Baška Voda stáva významným prístavom tejto oblasti, cez ktorý sa rozvíjal intenzívny obchod medzi ostrovmi a Zabiokovím.