À la fin au XVIIe siècle, après le passage de la menace représentée par les pirates et la défaite des Ottomans (1684), la population retourne sur la côte et établit progressivement une nouvelle colonie, dont le nom, Baška Voda, est mentionnée pour la première fois en 1688. Le premier bâtiment public est la petite église de Saint-Laurent du Baroque tardif, érigée en 1750 sur les fondements d'une construction antique. La population, qui pratique l'agriculture, se tourne vers la mer et pratique la pêche et la navigation. La première école est ouverte en 1845. En 1889 l'église de Saint-Nicolas de style néo-roman est édifiée, alors que la poste ouvre ses portes en 1900.
En 1912, la construction du port permet à Baška Voda de devenir le plus important port de la région, et un lieu de transit commercial entre les îles et les localités du versant opposé du massif de Biokovo.